- Docking@Home
-
Docking@Home Тип Операционная система Аппаратная платформа Последняя версия • Charmm 34a2: 6.23
Состояние Активное
Сайт Docking@Home Платформа BOINC Объём загружаемого ПО 7.7 МБ Объём загружаемых данных задания 1.2 МБ Объём отправляемых данных задания 75—100 КБ Объём места на диске 11 МБ Используемый объём памяти 169 МБ Графический интерфейс есть Среднее время расчёта задания 5.5 часов Deadline 14 дней Возможность использования GPU нет Docking@Home — проект добровольных вычислений, работающий на платформе BOINC. Проект организован университетом Делавэра. Основной задачей проекта является моделирование взаимодействия потенциальных лекарственных средств с белками (докинг).[1]
Содержание
Докинг
Молекулярный докинг представляет собой поиск лиганд-белковых комплексов, имеющих минимальную свободную энергию, то есть таких, компоненты которых оптимальным образом «подходят» друг к другу. Поиск таких комплексов — задача, которая хорошо распараллеливается, и поэтому подходит для распредёленных вычислений.[2] В проекте Docking@Home моделирование связывания лиганда с сайтом связывания белка проводится при помощи программного модуля CHARMM. Процесс состоит из нескольких независимых попыток с различной пространственной ориентацией и конформацией лиганда.[1]
Детали проекта и статистика
Этот раздел не завершён. Вы поможете проекту, исправив и дополнив его.Научные достижения
Этот раздел не завершён. Вы поможете проекту, исправив и дополнив его.Примечания
- ↑ 1 2 http://ieeexplore.ieee.org/xpl/freeabs_all.jsp?arnumber=4228396 pdf
- ↑ Stephen Childs; Luc Bouge; Martti Forsell; Träff, Jesper; Achim Streit; Ziegler, Wolfgang; Alexander, Michael Van Cleave Euro-Par 2007 Workshops: Parallel Processing: HPPC 2007, UNICORE Summit 2007, and VHPC 2007, Rennes, France, August 28-31, 2007, Revised Selected Papers (Lecture Notes in Computer Science). — Berlin: Springer, 2008. — P. 85. — ISBN 3-540-78472-1
См. также
Ссылки
Проекты добровольных вычислений Астрономия Albert@Home • Asteroids@home • Constellation • Cosmology@home • Einstein@Home • MilkyWay@home • Orbit@home • PlanetQuest • SETI@home • theSkyNet POGS
Биология и
медицинаBiochemical Library • Cels@Home • CommunityTSC • Correlizer • Docking@Home • DrugDiscovery@Home • DNA@Home • evo@home • evolution@home • FightAIDS@Home • FightMalaria@Home • Folding@home • GPUGrid • Lattice Project • Malariacontrol.net • Neurona@Home • NRG • Poem@Home • Predictor@home • Proteins@Home • QMC@Home • RALPH@Home • RNA World • Rosetta@home • SIMAP@home • SimOne@home • Superlink@Technion • United Devices Cancer Research Project • Volpex@UH • Wildlife@Home
Когнитивные Artificial Intelligence System • MindModeling@Home
Климат APS@Home • BBC Climate Change Experiment • ClimatePrediction.net • Seasonal Attribution Project • Quake Catcher Network - Seismic Monitoring • Virtual Prairie
Математика ABC@home • AQUA@home • Chess960@home • Collatz Conjecture • distributed.net • Enigma@Home • EulerNet • GIMPS • NFSNET • NQueens Project • NumberFields@Home • OProject@Home • PiHex • PrimeGrid • Ramsey@Home • Rectilinear Crossing Number • SAT@home • SHA-1 Collision Search Graz • SubsetSum@Home • RainbowCrack • Seventeen or Bust • SZTAKI Desktop Grid • WEP-M+2 Project • Wieferich@Home • VGTU@Home
Физико-
техническиеBRaTS@Home • CuboidSimulation • eOn • Hydrogen@Home • Leiden Classical • LHC@home • Magnetism@home • µFluids@home • Muon1 DPAD • NanoHive@Home • SLinCA@Home • Solar@Home • Spinhenge@home • QuantumFIRE
Многоцелевые AlmereGrid • CAS@Home • EDGeS@Home • Ibercivis • Optima@home • World Community Grid • Yoyo@home
Прочие Africa@HOME • BURP • DepSpid • DIMES • Ideologias@Home • FreeHAL@home • Gerasim@Home • Pirates@Home • RenderFarm@Home • RND@home • Surveill@Home • YAFU
Утилиты BOINC (Account Manager • Manager • client-server technology • Credit System • Wrapper • WUProp)
Категории:- Программное обеспечение по алфавиту
- Биомедицинские проекты распределённых вычислений
- Проекты добровольных вычислений
Wikimedia Foundation. 2010.